Kroz forme modula Protokol i komisija se vrši unos zahtjeva tj. protokola i komisija vrši odbijanje / odobrenje tih zahtjeva.
Koriste se šifrarnici predmeta protokola i liječnici.
U šifrarniku predmeti protokola korisnik definiše različite vrste protokola koje se pojavljuju u radu, dok je šifrarnik liječnici preuzet iz modula Likvidature.
